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《燕麥嗜酸菌西瓜亞種溯源檢測方法》征求意見稿發(fā)布

2021-01-13 09:37:29 來源：化工儀器網(wǎng) 閱讀量：6301

　　燕麥嗜酸菌西瓜亞種是近年由國外傳入的毀滅性病害，除為害西瓜外，還會為害黃瓜和西葫蘆，病菌附著在種子或病殘體上越冬，曾導致了嚴重的經(jīng)濟損失，80%的西瓜不能上市銷售。該病菌在世界范圍內(nèi)廣泛分布，寄主眾多，對該病原菌來源地、宿主等信息進行溯源，明確宿主、來源地與物種生物信息之間的規(guī)律性，有利于掌握病菌致病規(guī)律，從而能有效制定相應的預警和防控策略。

　　根據(jù)“十三五”國家重點研發(fā)計劃專項“國家質(zhì)量基礎(chǔ)的共性技術(shù)研究與應用”中《高頻跨境生物多目標高精準檢測技術(shù)研究》項目，中華人民共和國深圳出入境檢驗檢疫局、深圳市檢驗檢疫科學研究院篩選研究適用于燕麥嗜酸菌西瓜亞種寄主、來源地等溯源信息的核酸基因片段，通過生物信息學、統(tǒng)計學、群體生態(tài)學等研究技術(shù)和方法構(gòu)建了溯源信息的系統(tǒng)進化和網(wǎng)絡(luò)進化關(guān)系對物種歸類鑒定，并于近日發(fā)布了《燕麥嗜酸菌西瓜亞種溯源檢測方法》征求意見稿。

　　《燕麥嗜酸菌西瓜亞種溯源檢測方法》的內(nèi)容包括有范圍、病菌的基本信息、方法原理、儀器用具、溯源檢測方法、結(jié)果判斷、樣品與原始數(shù)據(jù)集保存以及資料性附錄。標準規(guī)定了應用生物信息學分析方法對燕麥嗜酸菌西瓜亞種進行溯源檢測的方法，其原理是通過對物種具有溯源價值和意義的基因片段的擴增，利用已完成的核酸序列與系統(tǒng)進化和網(wǎng)絡(luò)進化圖對物種進行歸類鑒定，檢測過程是應用生物信息學的分析手段篩選有效區(qū)分種內(nèi)差異并且有效歸類的基因片段或分子標記獲得這些基因片段或分子標記的核酸序列，應用統(tǒng)計學手段完成核酸序列與來源地、寄主信息的主成分分析，完成不同來源地、寄主個體的群體分子系統(tǒng)凈化關(guān)系和群體結(jié)構(gòu)分析。

　　為確保試驗的順利進行，標準中還規(guī)定了需要用到保濕培養(yǎng)箱、超凈工作臺、滅菌箱、-80℃低溫冰箱、pcr擴增儀、冷凍離心機、核酸蛋白分析儀、電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)、高壓滅菌鍋等精密儀器設(shè)備。

　　本標準的實施，不僅可以快速、準確、簡便的對燕麥嗜酸菌西瓜亞種溯源信息進行檢測，也可以為燕麥嗜酸菌西瓜亞種寄主植物及植物產(chǎn)品的進境和管理提供技術(shù)保障。故而希望相關(guān)單位能在規(guī)定時間內(nèi)仔細研核本標準征求意見稿，并提出建設(shè)性意見，為標準的進一步完善添磚加瓦。

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