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微生物代謝的酶活性的調(diào)節(jié)
閱讀:540 發(fā)布時(shí)間:2022-11-17微生物代謝的酶活性的調(diào)節(jié)
這是通過(guò)改變酶分子的活性來(lái)調(diào)節(jié)代謝速度的種調(diào)節(jié)方式。與酶合成的調(diào)節(jié)相比,這種方式更直接,見(jiàn)效更快。通常酶活性的調(diào)節(jié)是在些小分子的影響下進(jìn)行的。這些小分子存在于細(xì)胞內(nèi),通過(guò)作用于些代謝途徑的關(guān)鍵酶,改變這些關(guān)鍵酶活性的強(qiáng)弱,從而影響整個(gè)代謝途徑,起到調(diào)節(jié)新陳代謝的作用。常見(jiàn)的酶活性調(diào)節(jié)的方式有別構(gòu)調(diào)節(jié)、共價(jià)修飾等。
下面重點(diǎn)介紹這兩種方式。
1.別構(gòu)調(diào)節(jié)
酶是種生物大分子,其化學(xué)本質(zhì)主要是蛋白質(zhì)。酶的催化活性是由其分子的空間構(gòu)象決定的。在些小分子物質(zhì)或蛋白質(zhì)分子的作用下,酶分子的空間構(gòu)象能發(fā)生改變,使得其催化活性也發(fā)生變化,這種現(xiàn)象稱(chēng)為別構(gòu)效應(yīng)(變構(gòu)效應(yīng))。別構(gòu)調(diào)節(jié)就是依據(jù)酶分子的別構(gòu)效應(yīng)來(lái)調(diào)節(jié)酶活性的種方式。這些具有別構(gòu)效應(yīng)的酶稱(chēng)為別構(gòu)酶(變構(gòu)酶)。能引起別構(gòu)效應(yīng)的小分子物質(zhì)或蛋白質(zhì)分子稱(chēng)為別構(gòu)效應(yīng)物(變構(gòu)效應(yīng)物)。別構(gòu)效應(yīng)物對(duì)酶活性的改變可以是激活,也可以是抑制。激活過(guò)程的效應(yīng)物稱(chēng)為激活劑;抑制過(guò)程的效應(yīng)物稱(chēng)為抑制劑。而這些效應(yīng)物常是酶催化的反應(yīng)途徑的上游底物,下游產(chǎn)物,底物、產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)類(lèi)似物和些調(diào)節(jié)性代謝物。我們把上游底物對(duì)酶活性的調(diào)節(jié)稱(chēng)為前饋,而把下游產(chǎn)物對(duì)酶活性的調(diào)節(jié)稱(chēng)為反饋。前饋激活和反饋抑制是兩種常見(jiàn)的機(jī)制。
別構(gòu)效應(yīng)是格哈特(J.Gerhart)和帕迪(A.pardee)在1962年研究胞苷三磷酸(CTp)對(duì)其自身合成途徑中的個(gè)催化酶-天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶(ATCase)的反饋抑制時(shí)發(fā)現(xiàn)的。別構(gòu)酶的反應(yīng)速率和底物濃度的關(guān)系曲線(xiàn)與般酶不同。
以ATCase為例,該酶催化氨甲酰磷酸和天冬氨酸反應(yīng)生成氨甲酰天冬氨酸。維持氨甲酰磷酸濃度過(guò)量,改變天冬氨酸的濃度[S],分別測(cè)定不同天冬氨酸濃度時(shí)的ATCase酶促反應(yīng)初速度v0,再以v0對(duì)[S]作圖,所得的曲線(xiàn)為近S型,而非普通米氏酶所呈現(xiàn)的雙曲線(xiàn)型。這種酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)特征不是ATCase所*的,許多別構(gòu)酶都是這樣。如果在反應(yīng)體系中分別加入CTp和ATp,再測(cè)定得到的動(dòng)力學(xué)曲線(xiàn),則前者更接近s型,而后者更接近雙曲線(xiàn)型。CTp作為種別構(gòu)抑制劑,抑制了ATCase的活力,提高了Km值;ATp則作為種別構(gòu)激活劑,增強(qiáng)了ATCase的活力,降低了Km值。關(guān)于ATCase三維結(jié)構(gòu)的研究顯示,該酶由6個(gè)亞基組成,亞基分成上下兩層,背靠背排列。每個(gè)亞基以?xún)煞N不同的構(gòu)象態(tài)(R態(tài)和T態(tài))存在,并且在無(wú)任何配體存在時(shí),兩種構(gòu)象態(tài)處于平衡中。R態(tài)為松弛態(tài),對(duì)底物的親和力高;T態(tài)為緊張態(tài),對(duì)底物的親和力低。催化部位和調(diào)節(jié)部位分布在不同的亞基上,催化部位處于催化亞基結(jié)合形成的溝內(nèi),調(diào)節(jié)部位則處于調(diào)節(jié)亞基的外側(cè)表面,此部位是CTp和ATp的競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合位點(diǎn)。當(dāng)ATp與個(gè)調(diào)節(jié)亞基上的調(diào)節(jié)部位結(jié)合以后,會(huì)促使其他亞基的構(gòu)象由T態(tài)向R態(tài)轉(zhuǎn)變,增強(qiáng)酶與底物的親和力,提高酶活力。
CTp的作用則正好相反,CTp與調(diào)節(jié)亞基結(jié)合會(huì)促使其他亞基的構(gòu)象由R態(tài)向T態(tài)轉(zhuǎn)變,減弱酶與底物的親和力,降低酶活力。
ATCase在別構(gòu)酶中是具有代表性的。別構(gòu)酶往往都具有調(diào)節(jié)部位和催化部位,兩者是分開(kāi)的,但可以同時(shí)被結(jié)合,而且調(diào)節(jié)位點(diǎn)??山Y(jié)合不同配體,產(chǎn)生不同的效應(yīng)。另外,別構(gòu)酶通常都是寡聚酶,般具有多個(gè)亞基,包括催化亞基和調(diào)節(jié)亞基。個(gè)亞基上的結(jié)合位點(diǎn)與配體的結(jié)合會(huì)影響到同分子中另亞基上的結(jié)合位點(diǎn)與底物的結(jié)合,這種現(xiàn)象稱(chēng)為協(xié)同效應(yīng)。協(xié)同效應(yīng)分為兩種:如果起始的配體結(jié)合能促進(jìn)分子中另亞基上的結(jié)合位點(diǎn)與底物結(jié)合,稱(chēng)為正協(xié)同效應(yīng);如果起始的配體結(jié)合能抑制分子中另亞基上的結(jié)合位點(diǎn)與底物結(jié)合,稱(chēng)為負(fù)協(xié)同效應(yīng)。ATp對(duì)ATCase的作用就是種正協(xié)同效應(yīng);而CTp對(duì)ATCase的作用則是種負(fù)協(xié)同效應(yīng)。
別構(gòu)調(diào)節(jié)是生物體調(diào)節(jié)新陳代謝的重要方式,特別是在代謝途徑的支點(diǎn)和代謝可逆步驟(如糖酵解、糖異生和TCA循環(huán))中尤為重要。
這些代謝途徑的關(guān)鍵酶往往都是別構(gòu)酶,從而使得些代謝途徑在細(xì)胞內(nèi)同空間同時(shí)發(fā)生時(shí)能夠相互協(xié)調(diào),不會(huì)彼此干擾。下面以巴斯德效應(yīng)(pasteur effect)為例,說(shuō)明微生物如何利用別構(gòu)調(diào)節(jié)來(lái)調(diào)控糖的分解代謝。巴斯德效應(yīng)是巴斯德(L.pasteur)在研究酵母菌的酒精發(fā)酵時(shí)發(fā)現(xiàn)的。酵母菌在厭氧條件下,能分解葡萄糖,產(chǎn)生酒精,而且消耗葡萄糖的速度很快;而如果在發(fā)酵液中通入氧,酒精的產(chǎn)量會(huì)下降,葡萄糖被消耗的速度也會(huì)減慢。這種呼吸抑制發(fā)酵的現(xiàn)象,稱(chēng)為巴斯德效應(yīng)。酵母菌在無(wú)氧條件下時(shí),由于呼吸鏈的效率下降,NADh不能順利進(jìn)入呼吸鏈,[NADh]/[NAD+]比值上升,使得丙酮酸脫氫酶系、異檸檬酸脫氫酶和a酮戊二酸脫氫酶系的活性受到抑制。而TCA循環(huán)是糖類(lèi)物質(zhì)分解代謝途徑中產(chǎn)生能量的主要步驟,該循環(huán)效率下降會(huì)使細(xì)胞的能荷降低,ATp分子減少,ADp和AMp分子增多,糖酵解的關(guān)鍵酶-磷酸果糖激酶的活性被ADp和AMp別構(gòu)激活,糖酵解加快。較高的[NADh]/[NAD+]比值也有利于乙醇脫氫酶將乙醛轉(zhuǎn)變成乙醇。結(jié)果就是,在無(wú)氧條件下,酵母菌快速消耗葡萄糖,并大量生成酒精。而如果在發(fā)酵體系中通入氧,由于氧的介入,呼吸鏈效率提高,NADh會(huì)順利進(jìn)入呼吸鏈,產(chǎn)生ATp,[NADh]/[NAD+]比值下降。同時(shí),TCA循環(huán)效率上升,并大量生成NADh和FADh2,通過(guò)呼吸鏈再生成ATp。結(jié)果是,細(xì)胞中的能荷提高了,ATp分子增多,ADp和AMp分子減少。由于異檸檬酸脫氫酶活性受到ATp的別構(gòu)抑制,導(dǎo)致了檸檬酸的積累,而檸檬酸和ATp都是磷酸果糖激酶的別構(gòu)抑制劑,從而使糖酵解速度減慢。同時(shí),較低的
[NADh]/[NAD+]比值不利于乙醇脫氫酶產(chǎn)生乙醇。因此,在這種情況下,葡萄糖消耗速度減慢,酒精的產(chǎn)量也下降了。
2.共價(jià)修飾
酶分子中的個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基被某些化學(xué)基團(tuán)共價(jià)結(jié)合或解開(kāi),使其活性發(fā)生改變的現(xiàn)象稱(chēng)為共價(jià)修飾。和別構(gòu)調(diào)節(jié)相比,別構(gòu)調(diào)節(jié)只改變酶分子的構(gòu)象,不改變酶分子的共價(jià)結(jié)構(gòu);而共價(jià)修飾則改變了酶分子的共價(jià)結(jié)構(gòu)。按照此共價(jià)結(jié)構(gòu)變化是否可逆,共價(jià)修飾可以分為兩種:種是可逆的,稱(chēng)為可逆共價(jià)修飾;另種是不可逆的,稱(chēng)為不可逆共價(jià)修飾。
(1)可逆共價(jià)修飾
可逆共價(jià)修飾可使原本無(wú)活性的酶活化,也可使原本有活性的酶鈍化。可用于修飾的化學(xué)基團(tuán)有磷酸基、乙?;?、甲基、乙基、腺苷?;?、尿苷?;?。其中,磷酸基的修飾(即磷酸化)普遍的。真核細(xì)胞中1/3~1/2的蛋白質(zhì)可被磷酸化。組成蛋白質(zhì)的Ser、Thr、Tyr殘基,由于其氨基酸側(cè)鏈上有羥基,常被作為磷酸化的位點(diǎn)。例如,糖原的分解和合成代謝的調(diào)控就利用了這種機(jī)制。糖原分解的限速酶是糖原磷酸化酶,糖原合成的限速酶是糖原合成酶。這兩個(gè)酶均具有活性和非活性?xún)煞N形式(a型和b型)。糖原磷酸化酶的a型是被磷酸化的,有活性;而b型是去磷酸化的,無(wú)活性。糖原合成酶的a型是去磷酸化的,有活性;而b型是磷酸化的,無(wú)活性。當(dāng)糖原磷酸化酶和糖原合成酶均被磷酸化時(shí),糖原磷酸化酶被活化,而糖原合成酶被鈍化,于是,糖原分解代謝加強(qiáng),糖原合成代謝減弱。當(dāng)糖原合成酶和糖原磷酸化酶均被去磷酸化時(shí),糖原磷酸化酶被鈍化,糖原合成酶則被活化,使得糖原合成代謝加強(qiáng),糖原分解代謝減弱。這樣來(lái),當(dāng)糖原磷酸化酶充分活動(dòng)時(shí),糖原合成酶幾乎不起作用;當(dāng)糖原合成酶活躍時(shí),糖原磷酸化酶又受到抑制。
可逆共價(jià)修飾中,酶構(gòu)型的轉(zhuǎn)變是在另些酶的催化下完成的,可在很短的時(shí)間內(nèi)觸發(fā)大量有活性的酶,其作用效率是高的。并且,這種機(jī)制可使些酶經(jīng)常在活化與鈍化之間來(lái)回變換,根據(jù)生物體代謝狀況的變化隨時(shí)作出響應(yīng)。不過(guò),這種變換和響應(yīng)是需要消耗能量的,雖然這部分能量對(duì)于整個(gè)細(xì)胞來(lái)說(shuō)只是很小的部分,但也是細(xì)胞為實(shí)現(xiàn)對(duì)其代謝的精密調(diào)控所付出的代價(jià)。
(2)不可逆共價(jià)修飾
不可逆共價(jià)修飾的典型例子就是酶原激活。沒(méi)有活性的酶的前體稱(chēng)為酶原。酶原轉(zhuǎn)變成有活性的酶的過(guò)程稱(chēng)為酶原的激活。酶原激活過(guò)程的實(shí)質(zhì)就是酶原中的些小肽段被切除以后,使酶的活性部位形成和暴露的過(guò)程。例如,原的激活是其N(xiāo)端被切掉了個(gè)己肽(Val固AspEAspEAspEAspLys),該過(guò)程是在腸激酶的催化下完成的,少量的腸激酶可以激發(fā)大量的。在組織細(xì)胞中,某些酶以酶原的形式存在,可保護(hù)分泌這種酶的組織細(xì)胞不被破壞。然而,這種機(jī)制是不可逆的,旦酶原被激活,待其完成了其催化使命以后,便被降解,不能再恢復(fù)成酶原。
3.其他調(diào)節(jié)方式
(1)締結(jié)與解離
某些酶蛋白由多個(gè)亞基組成,亞基之間的締結(jié)與解離可以使酶分子實(shí)現(xiàn)活化與鈍化。這類(lèi)相互轉(zhuǎn)變是由共價(jià)修飾或由若干配基的締合啟動(dòng)的。(2)競(jìng)爭(zhēng)性抑制
些酶的生物活性受到代謝物的競(jìng)爭(zhēng)性抑制,其實(shí)質(zhì)是某些代謝物與底物競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合酶的催化位點(diǎn),導(dǎo)致酶活受到抑制。例如,需要NAD+參與的酶促反應(yīng)常受到NADh的競(jìng)爭(zhēng)性抑制:需要ATp參加的反應(yīng)可能受ADp和AMp的競(jìng)爭(zhēng)性抑制;還有些酶促反應(yīng)常受到產(chǎn)物的競(jìng)爭(zhēng)性抑制。
(3)酶的降解
酶分子被合成出來(lái)以后,能夠維持段時(shí)間的生物活性,然后被生物降解。不同的酶半衰期不同,短的只有幾分鐘,長(zhǎng)的可以達(dá)到幾天。調(diào)節(jié)酶的半衰期長(zhǎng)短也是生物體調(diào)節(jié)酶活性的種方式。例如當(dāng)環(huán)境突然發(fā)生變化時(shí),細(xì)胞中的某些代謝途徑需要關(guān)閉,而此前些相關(guān)的代謝酶已經(jīng)被合成出來(lái)了,細(xì)胞需要鈍化這些酶,以避免不必要的酶促反應(yīng)對(duì)細(xì)胞造成傷害,于是些蛋白酶會(huì)被激活,這些蛋白酶會(huì)有選擇性地降解些酶分子,以關(guān)閉這些代謝途徑。